TMpiChainCollector Class module:SampleCollector file:SampleCollector

Subroutines Expand Arguments

• AddNewPoint(this, like, P)
  • TMpiChainCollector   :: this
  • real(mcp) intent(in) :: like
  • real(mcp)  :: P(:)
• AddNewWeightedPoint(this, CurParams, CurLike, mult, thin_fac)
  • TMpiChainCollector   :: this
  • TCalculationAtParamPoint intent(in)  :: CurParams
  • real(mcp)  :: CurLike
  • real(mcp) intent(in) :: mult the weight, usually integer for standard chains
  • integer intent(in), optional :: thin_fac
• ReadCheckpoint(this)
  • TMpiChainCollector   :: this
• ReadParams(this, Ini)
  • TMpiChainCollector   :: this
  • TSettingIni   :: Ini
• ReadState(this, F)
  • TMpiChainCollector   :: this
  • TFileStream   :: F
• SaveState(this, F)
  • TMpiChainCollector   :: this
  • TFileStream   :: F
• TMpiChainCollector_Clear(this)
  • TMpiChainCollector   :: this
• UpdateCovAndCheckConverge(this)
  • TMpiChainCollector   :: this
• WriteCheckpoint(this)
  • TMpiChainCollector   :: this

Functions  Expand Arguments

• logical CheckLimitsConverge(this, L, MpiCovmat)

  Check limits from last half chains agree well enough across chains to be confident of result Slowly explored tails will cause problems (long time till stops)

  • TMpiChainCollector   :: this
  • TSampleList intent(in)  :: L
  • real(mcp) intent(in) :: MpiCovmat(:,:)

Properties

• integer  :: sample_num
• real(mcp)  :: StartLike
• logical  :: Burn_done
• logical  :: all_burn
• logical  :: DoUpdates
• logical  :: flukecheck
• integer  :: indep_sample
• TBinaryFile  :: OutDataFile 
• real(mcp)  :: acc
• integer  :: checkpoint_burn
• integer  :: checkpoint_freq
• integer allocatable, dimension(:) :: req
• integer allocatable, dimension(:) :: buf
• integer allocatable, dimension(:) :: param_changes
• logical  :: Waiting
• logical  :: done_check
• TMPIData  :: Mpi 
• TSampleList  :: Samples 
• TChainSampler  :: Sampler pointer

Tree Diagrams

• TSaveLoadStateObject
  • TCheckpointable
    • TConfigClass
      • TSampleCollector
        • TMpiChainCollector